circRNA 是一类区别于传统线性RNA的非编码RNA分子，呈闭合环状结构，对RNase R不敏感，比线性RNA更加稳定。circRNA 具有进化保守性，表达具有组织和时空特异性。circRNA 功能众多，可作为 miRNA 的海绵，竞争性结合miRNA，发挥 ceRNA 的调控功能，调控基因表达。近年来还发现与疾病的发生和发展密切相关，在疾病诊断标记物等方向具有很大的应用前景。

技术路线

服务内容 & 样本要求

项目周期

30天（自然日）

测序平台及策略

Hiseq PE150/NovaSeq6000 PE150

测序数据量

去rRNA链特异文库≥12G

去线性RNA链特异文库6-8G

样本类型	样品量需求	无降解RNA
组织	≥1g	总量≥5μg，浓度≥150ng/μl OD260/280=1.8~2.2 RIN ≥6.5，28S/18S≥1.0
细胞	≥10⁷ 个
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circRNA 经典案例解析

circBIRC6 参与干细胞多能性调控（Nature Communications）
越来越多的证据表明环状RNAs（circRNAs）在人体内转录丰富。然而，它们参与生物过程，包括多能性，仍然不清楚。我们在未分化的人类胚胎干细胞（hESCs）中鉴定了一系列的富含的circRNAs，并证明了其中两种，circBIRC6和circCORO1C在功能上与细胞多能状态相关。我们发现circBIRC6在AGO2复合物中富集，并直接与miR-34a和miR-145相互作用，而它们已知在调节维持多能性的靶基因中起作用。相应地，circBIRC6减弱这些靶基因的下调并抑制hESC分化。我们进一步确定富含hESC的剪接因子（SF），以及证明circBIRC6在胚胎干细胞中的生物发生被SF ESRP1所促进，SFESRP1表达由核心多能性相关因子OCT4和NANOG控制。总的来说，我们的数据表明，circRNA作为一种microRNA“海绵”来调节分子通路，调节人类多能性和分化。
参考文献： Yu CY, Li TC, Wu YY, et al. 2017. The circular RNA circBIRC6 participates in the molecular circuitry controlling human pluripotency. Nature Communications,2017, 8:1149.

circBIRC6 参与干细胞多能性调控（Nature Communications）

越来越多的证据表明环状RNAs（circRNAs）在人体内转录丰富。然而，它们参与生物过程，包括多能性，仍然不清楚。我们在未分化的人类胚胎干细胞（hESCs）中鉴定了一系列的富含的circRNAs，并证明了其中两种，circBIRC6和circCORO1C在功能上与细胞多能状态相关。我们发现circBIRC6在AGO2复合物中富集，并直接与miR-34a和miR-145相互作用，而它们已知在调节维持多能性的靶基因中起作用。相应地，circBIRC6减弱这些靶基因的下调并抑制hESC分化。我们进一步确定富含hESC的剪接因子（SF），以及证明circBIRC6在胚胎干细胞中的生物发生被SF ESRP1所促进，SFESRP1表达由核心多能性相关因子OCT4和NANOG控制。总的来说，我们的数据表明，circRNA作为一种microRNA“海绵”来调节分子通路，调节人类多能性和分化。

参考文献：

Yu CY, Li TC, Wu YY, et al. 2017. The circular RNA circBIRC6 participates in the molecular circuitry controlling human pluripotency. Nature Communications,2017, 8:1149.

转录调控测序

circRNA 测序