转录调控测序

lncRNA 测序

长链非编码 RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)一类长度大于 200 nt 且不编码蛋白质的 RNAs(不含 rRNA),广泛存在于各种生物体内。lncRNAs 参与表观遗传、转录以及转录后等多水平的调控过程,在生命活动中具有重要作用。

技术路线

技术路线

服务内容 & 样本要求

项目周期

项目周期

30天(自然日)
测序平台及策略

测序平台及策略

Hiseq PE150/NovaSeq6000 PE150
测序数据量

测序数据量

12G
样品类型 样品量需求 样品纯度需求
植物/动物样本 总量≥2.5μg,浓度≥50ng/μL RIN ≥6.5,28S/18S≥1.0,A260/280≥1.9~2.2,A260/280≥1.8~2.2

lncRNA 测序案例解析

人类全基因组范围内大规模 LncRNA 的表达鉴定

LncRNA 在许多生理过程及疾病发生中都发挥着非常重要的调控作用,为比较全面地了解全基因组范围内 LncRNA 的表达情况,本项目整合了 25 个研究中的 7256 个 RNA-Seq 的数据,对来源于肿瘤组织、正常组织和细胞系的 43T 数据进行了整理分析,阐明了与癌症显著相关的 LncRNA。整个项目中对 LncRNA 表达谱的构建可能用于解释生物学过程和癌症的发病机理,对于生物标记的开发也具有很高的应用价值

lncRNA 测序案例解析

参考文献:

Lyer MK, Niknafs YS, Malik R, et al. The landscape of long noncoding RNAs in the human transcriptome.Nat Genet. 2015 Mar; 47(3): 199–208.

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