转录调控测序

Transcriptional regulatory sequencing

转录组测序

转录组测序(mRNA-Seq)是使用高通量测序技术,在给定时刻从一个基因组中,揭示 RNA 的存在和数量的一个快照的技术,为生命科学研究提供了全新的角度,可用于预测基因结构、可变剪切和其他转录修饰,并可定量测定每个转录本在生长过程中和不同条件下表达水平的变化。

技术路线

技术路线

服务内容 & 样本要求

项目周期

项目周期

30天(自然日)
测序平台及策略

测序平台及策略

HiSeq X ten PE150
NovaSeq 6000
测序数据量

测序数据量

6G/8G/10G/12G
样本类型 样品量需求 样品纯度需求
动物/植物样本 总量≥1μg,浓度≥50ng/μL OD260/280≥1.8,RIN ≥7,28S/18S≥1.0

转录组测序案例解析

PTPRZ1-MET 融合基因在继发性胶质母细胞瘤中的表达(Genome Research)

该研究利用转录组测序技术,对272个WHO二级、三级和四级胶质瘤的转录本融合进行分类。发现融合基因在恶性胶质瘤、典型的胶质瘤亚型以及放射/替莫唑胺治疗的胶质瘤中更为常见。67个帧内融合转录子,包括3个复发的融合转录子:FGFR3-TACC3、RNF213-SLC26A11和PTPRZ1-MET(ZM)。研究描绘了胶质瘤进展过程中的RNA变化。

转录组测序案例解析

参考文献:

Bao Z S, Chen H M, Yang M Y, et al. RNA-seq of 272 gliomas revealed a novel, recurrent PTPRZ1-MET fusion transcript in secondary glioblastomas.[J]. Genome Research, 2014, 24(11):1765.

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