高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术("Next-generation" sequencingtechnology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和读长较短等为标志。
(1)多平台、多种测序模式可选择
5种国内外平台,有包芯片(包FC),包lane,测散库等服务内容
(2)国内外布局,全区域覆盖
(3)大范围应用场景包括临床医学、基础医学、农林畜牧、水产、环境科学、轻工业等应用领域
参数/仪器平台 | NovaSeq 6000 | HapSeq-2000 | NextSeq 500/550 | NovaSeqTMX Plus | DNBSEQ-T7 |
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Flow Cell 类型 | 4种(P1/P2/P3/P4) | 4种(P1/P2/P3/P4) | 2种(Mid/High) | 3种(1.5B/10B/25B) | 四联载片1lane/FC |
测序模式 | PE150/ PE50/PE250 |
PE150 | PE150 | 内容PE1506 | PE75/ PE100/PE150 |
Q30(%) | ≥85% | ≥85% | ≥85% | ≥85% | ≥85% |
运行时间/run | ~44h | ~34h ~44h | ~26h ~30h | ~48h | 22h~24h |
文库pooling单位 | 825Gb/lane 80Gb/FC 400Gb/FC | 60Gb/FC 180Gb/FC | 40Gb/FC 120Gb/FC | 1000Gb/lane | 3500M reads/FC 4500M reads/FC 1650Gb/FC |
应用范围 | 基因组测序、 转录组测序等 |
小型基因组测序等 | 基因panel、 转录组测序 |
基因组测序、 转录组测序等 |
基因组测序、 转录组测序等 |
运输建议:文库溶于Nuclease-free water;EP管装,冰袋邮寄即可
测序平台 | 文库插入片段 | 文库质量标准 | 体积 | ≥1ng/μl |
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NovaSeq6000 | 150-580bp | 引物二聚体/接头二聚体占比≤0.5% | ≥15μl | ≥1ng/μl |
NovaSeqTMXPlus | 150-580bp | ≥20μl | ≥1ng/μl |
测序平台 | 引物浓度 | read1((µl) | Read2(µl) | index1/2(μl) |
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NovaSeq6000 | 25(µM) | 160 | 80 | 120 |
50(µM) | 80 | 40 | 60 | |
100(µM) | 40 | 20 | 30 | |
NovaSeqTMXPlus | 0.3(µM) | 5 | 5 | 7 |
服务类型 | 文库类型 | 文库插入片段 | 文库质量标准 | 体积 | Qubit浓度 | 总量 |
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包FC | 单细胞oligo文库 | 170-500bp | 峰面积占总的 峰面积80%以上, 无明显拖尾现象 |
20-25μl | >10ng/μl | >450ng |
单细胞cDNA文库 | >10ng/μl | >450ng | ||||
华大5端BCR文库 | >10ng/μl | >450ng | ||||
华大5端TCR文库 | >10ng/μl | >450ng | ||||
华大单细胞ATAC文库 | >10ng/μl | >450ng | ||||
华大时空转录组文库(PE75模式) | >8ng/μl | >480ng | ||||
华大时空转录组文库(PE100模式) | >3ng/μl | >380ng | ||||
illumina文库 | >3ng/μl | >150ng | ||||
散库 | 单细胞oligo文库 | >10ng/μl | >300ng | |||
单细胞cDNA文库 | >10ng/μl | >300ng | ||||
华大5端BCR文库 | >10ng/μl | >300ng | ||||
华大5端TCR文库 | >10ng/μl | >300ng | ||||
华大单细胞ATAC文库 | >10ng/μl | >300ng | ||||
华大时空转录组文库(PE75模式) | >8ng/μl | >250ng | ||||
华大时空转录组文库(PE100模式) | >3ng/μl | >200ng | ||||
illumina文库 | >2.5ng/μl | >50ng |