宏基因组测序,是对环境样品中全部微生物的总DNA进行高通量测序,主要研究微生物种群结构、基因功能、微生物之间的相互协作关系以及微生物与环境之间的关系。宏基因组测序研究摆脱了微生物分离纯培养的限制,扩展了微生物资源的利用空间,为环境微生物群落的研究提供了有效工具。
(1)严格标准的实验流程,分析内容丰富全面
(2)大数据分析团队和多中心大项目分析经验
(3)精确到菌株水平,可研究基因功能
指标 | 参数 |
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检测区域 | 微生物基因组区域 |
仪器平台 | NovaSeq6000 PE150 |
测序数据量 | 6G |
周期 | 50个自然日 |
菌群分辨率 | 种水平 |
样本类型 | 建议送样量 | 运输条件 | 生物重复 |
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人粪便 | ≥2g | -80℃保存,干冰寄送 | 一般情况下,自然环境中(如土壤)及模式动物 (如大、小鼠)建议每组至少5个生物学重复, 一般推荐10个生物学重复;若是人类肠道粪便等样品,由于个体之间差别较大, 建议每组不少于30个生物学重复 |
大/小鼠粪便 | ≥200mg | ||
肠道内容物 | ≥1g | ||
唾液样本 | ≥3ml | ||
口腔或皮肤拭子 | ≥5个 | ||
水体滤膜 | ≥2片(5 cm直径) | ||
土壤或淤泥 | ≥2g |