高通量单细胞V(D)J测序技术的核心主要涉及到单细胞水平的T细胞受体(TCR)和B细胞受体(BCR)的基因表达谱分析。同样将单细胞悬液借助微流控芯片形成油包水结构完成单细胞分离,随后进行核酸捕获和转录组文库及TCR/BCR文库构建,最后在数据分析阶段仍可通过细胞标签和转录本标签,将文库数据拆分到每个细胞和还原到真实基因表达水平分析得到TCR/BCR的多样性序列,用于肿瘤免疫微环境探索、免疫细胞调节机制探究等研究。。海普洛斯可提供10X Genomics、华大DNBelab C-Taim4等平台的单细胞免疫组测序。
(1)全链条,多平台的一站式单细胞测序解决方案
海普洛斯引进了10X Genomics、BD、DNBC4等国内外多种单细胞测序捕获平台,提供从组织消化到结果分析的一站式单细胞测序解决方案。
(2)200+ 肿瘤类型组织样本解离经验
海普洛斯专注于肿瘤临床科研领域,有丰富的肿瘤组织消化经验。除了常规的易消化组织如胃癌、肺癌、肠癌等样本类型,还通过技术优化,对一些疑难组织如胰腺癌、癌旁、血管、脂肪等样本类型有经验优势。
(3)更快,更省,更严格的建库测序方案
具备完善的物流渠道,通过引入8台Novaseq6000及Novaseq Xplus平台,打造超高通量的测序中心,极大的降低测序成本;2023年全国唯二通过NCCL的科服实验室全程严格地质量把控。
(4)多组学联合分析解决方案
通过持续完善的多组学服务,提供单细胞测序结合基因组学、转录组学、蛋白代谢组学、微生物组学等多组学联合分析服务,助力科研成果转化。
指标 | 参数 |
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检测区域 | 5’mRNA+TCR/BCR |
仪器平台 | 10X Genomics、C4 |
测序数据量 | cDNA 5W reads/cell;TCR/BCR 5Kreads/cell |
周期 | 30个自然日 |
适用物种 | 人及小鼠 |
适用样本类型 | 细胞悬液、新鲜组织、新鲜血液、外周血单核细胞(PBMCs)、穿刺样本 |
样本类型 | 建议送样量 | 运输条件 |
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组织 | ≥200mg(黄豆大小,0.5cm3) | 置于组织保存液中,2-8℃48小时内寄送 |
穿刺样本 | ≥2条(16G穿刺针,长度>1.5cm,乳腺癌穿刺3~4条) | 置于组织保存液中,2-8℃48小时内寄送 |
新鲜血液(默认提取PBMC) | 2-4ml,至少1ml | EDTA采血管收集,4℃寄送不超过12小时 |
冻存PBMC | 细胞量不低于30w(至少1ml) | 梯度降温冻存干冰运输,运输时间不限 |
单细胞悬液 | 细胞量不低于30w个 | |
体液 | 细胞总量≥10w(8-15ml腹水、关节液和脑脊液等体液,至少4ml) | 碎冰运输,运输过程中注意做好缓冲保护,避免样本剧烈震荡,短时间寄送,建议不超过4小时 |