RNA在转录调控的各方面起着非常重要的作用,RNA包括编码RNA和非编码RNA,非编码RNA又包括miRNA、lncRNA、circRNA等。全转录组测序就是通过高通量测序,一份样品,一次将全部RNA测序出来,研究各RNA、RNA-RNA之间表达、调控、生理代谢等各方面的作用机制。
(1)全转录组测序优势
全方面转录组水平分析,包含RNA互作模式,及ceRNA竞争网络分析等,从平面调控研究延伸至立体调控研究,全方位解析各种类RNA之间的关联互作。
(2)全面的产品解决方案
海普洛斯提供常见临床样本血液,组织,切片等,从方案设计,样本采集到数据分析全过程解决方案。
(3)周期优势
海普洛斯具备完善的 HiSeq X、NovaSeq6000等多规格的测序平台,常规周期50自然日,极速周期40自然日。
(4)分析优势
海普洛斯自主研发的开源分析软件,优化提速数据的多角度分析。
指标 | 参数 |
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检测范围 | LncRNA+mRNA+circRNA |
仪器平台 | Novaseq xplus/华大DNBSEQ-T7 |
测序数据量 | circRNA/15G+miRNA/3G(10M reads) |
周期 | 50自然日 |
交付标准 | 原始下机数据(fastq格式),Q30≥80% |
适用物种 | 人、大小鼠 |
产品类型 | 样本类型 | 建议送样量 | 保存、运输条件 |
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circRNA测序 | Total RNA | 2μg | 冻存管保存,干冰运输 |
新鲜动物组织 | 200mg | 液氮速冻,-80℃保存,干冰运输 | |
新鲜植物组织 | 500mg | 液氮速冻,-80℃保存,干冰运输 | |
新鲜培养细胞 | 10^6个 | trizol裂解,-80℃保存,干冰运输 | |
全血 | 4ml | PAXgene管保存,干冰运输 | |
血浆 | 2ml | EDTA管保存,-80℃保存,干冰运输 | |
血清 | 2ml | -80℃保存,干冰运输 |