时空蛋白转录组Stereo-CITE利用Stereo-seq芯片上装载的具有空间坐标信息的捕获探针,可在同一张组织切片上原位捕获组织中的mRNA分子和抗体衍生标签 (Antibody Derived Ta8,ADT)。利用磁珠纯化分离CDNA和ADT产物,并通过空间条形码(CoordinateID,CID)还原回空间位置,生成基因和蛋白表达图谱,可帮助我们深入理解生物体内基因与蛋白质复杂互作关系。
(1)空间组学多平台方案
海普洛斯提供10x Genomics Visium,华大Stereo Chip两种空间转录组捕获芯片,提供从组织切片到数据分析的一站式空间转录组测序解决方案。
(2)70+ 肿瘤类型组织样本解离经验
海普洛斯专注于肿瘤临床科研领域,拥有先进的冷冻切片机,搭配切片经验丰富的实验团队,已对多种肿瘤组织类型的切片厚度与切片温度进行测试优化,可为获得高质量冷冻切片提供硬件和技术保障。
(3)更快,更省,更严格的建库测序方案
具备完善的物流渠道,通过引入8台Novaseq6000及Novaseq Xplus平台,打造超高通量的测序中心,极大的降低测序成本;2023年全国唯二通过NCCL的科服实验室全程严格地质量把控。
(4)多组学联合分析解决方案
通过持续完善的多组学服务,提供单细胞测序结合基因组学、转录组学、蛋白代谢组学、微生物组学等多组学联合分析服务,助力科研成果转化。
指标 | 参数 |
---|---|
检测区域 | RNA+蛋白 |
仪器平台 | 华大Stereo-seq/td> |
测序数据量 | 1Greads+0.5Greads(1cm*1cm) |
周期 | 30个自然日 |
适用物种 | 人及大小鼠等真核生物 |
适用样本类型 | OCT包埋新鲜冷冻组织 |
样本类型 | 建议送样量 | 运输条件 |
---|---|---|
OCT包埋新鲜冷冻组织 | 制备OCT包埋冰冻组织块,建议组织横截面不超过6.5mm X 6.5mm,厚度不超过2cm,不低于5mm。 | 将组织包埋块使用锡纸包裹,并做好标记放入自封袋,在自封袋上做好记录,干冰寄送。 |