单细胞ATAC测序
产品介绍
产品概述
单细胞表观组测序主要通过转座酶对制备的细胞核悬液进行核 DNA 转座，然后将转座后的细胞核悬液进行基于微流控技术的上机捕获和单细胞ATAC和基因表达的文库构建及测序，可实现在单细胞表观基因组学水平上揭示染色质可接近性，通过单细胞染色质可接近性图谱构建，不仅能清晰了解染色质结构，还可以绘制高分辨率转录因子调控网络，为深入了解疾病的诊断和治疗铺平道路。海普洛斯可提供10X Genomics、华大DNBelab C-Taim4等平台的单细胞ATAC测序。
产品优势
（1）全链条，多平台的一站式单细胞测序解决方案
海普洛斯引进了10X Genomics、BD、DNBC4等国内外多种单细胞测序捕获平台，提供从组织消化到结果分析的一站式单细胞测序解决方案。
（2）200+ 肿瘤类型组织样本解离经验
海普洛斯专注于肿瘤临床科研领域，有丰富的肿瘤组织消化经验。除了常规的易消化组织如胃癌、肺癌、肠癌等样本类型，还通过技术优化，对一些疑难组织如胰腺癌、癌旁、血管、脂肪等样本类型有经验优势。
（3）更快，更省，更严格的建库测序方案
具备完善的物流渠道，通过引入8台Novaseq6000及Novaseq Xplus平台，打造超高通量的测序中心，极大的降低测序成本；2023年全国唯二通过NCCL的科服实验室全程严格地质量把控。
（4）多组学联合分析解决方案
通过持续完善的多组学服务，提供单细胞测序结合基因组学、转录组学、蛋白代谢组学、微生物组学等多组学联合分析服务，助力科研成果转化。
产品参数
| 指标 | 参数 |
|---|---|
| 检测区域 | 单细胞ATAC |
| 仪器平台 | 10X Genomics、C4 |
| 测序数据量 | 25K-40K reads/cell |
| 周期 | 30个自然日 |
| 适用物种 | 人及小鼠等真核生物 |
| 适用样本类型 | 细胞悬液、新鲜组织、新鲜血液、外周血单核细胞(PBMCs)、穿刺样本、冷冻组织等 |
送样指南
| 样本类型 | 建议送样量 | 运输条件 |
|---|---|---|
| 组织 | ≥200mg（黄豆大小，0.5cm3） | 置于组织保存液中，2-8℃48小时内寄送 |
| 穿刺样本 | ≥2条（16G穿刺针，长度>1.5cm，乳腺癌穿刺3~4条） | 置于组织保存液中，2-8℃48小时内寄送 |
| 新鲜血液（默认提取PBMC） | 2-4ml，至少1ml | EDTA采血管收集，4℃寄送不超过12小时 |
| 冻存PBMC | 细胞量不低于30w（至少1ml） | 梯度降温冻存干冰运输，运输时间不限 |
| 单细胞悬液 | 细胞量不低于30w个 | |
| 体液 | 细胞总量≥10w（8-15ml腹水、关节液和脑脊液等体液，至少4ml） | 碎冰运输，运输过程中注意做好缓冲保护，避免样本剧烈震荡，短时间寄送，建议不超过4小时 |