华大FFPE时空转录组产品是基于华大自主研发的DNBSEQ测序技术,利用携带空间条形码(Coordinate ID,CID)信息、规则阵列式排布的DNA纳米球(DNA Nano Ball,DNB),制备成时空芯片,利用“随机探针”对FFPE样本中组织细胞内的Total RNA分子进行原位捕获,并通过空间条形码(Coordinate ID,CID)还原回空间位置,实现全物种全转录组空间表达图谱的构建,助力临床科研深入理解疾病的发生与发展机制。
(1)空间组学多平台方案
海普洛斯提供10x Genomics Visium,华大Stereo Chip两种空间转录组捕获芯片,提供从组织切片到数据分析的一站式空间转录组测序解决方案。
(2)70+ 肿瘤类型组织样本解离经验
海普洛斯专注于肿瘤临床科研领域,拥有先进的冷冻切片机,搭配切片经验丰富的实验团队,已对多种肿瘤组织类型的切片厚度与切片温度进行测试优化,可为获得高质量冷冻切片提供硬件和技术保障。
(3)更快,更省,更严格的建库测序方案
具备完善的物流渠道,通过引入8台Novaseq6000及Novaseq Xplus平台,打造超高通量的测序中心,极大的降低测序成本;2023年全国唯二通过NCCL的科服实验室全程严格地质量把控。
(4)多组学联合分析解决方案
通过持续完善的多组学服务,提供单细胞测序结合基因组学、转录组学、蛋白代谢组学、微生物组学等多组学联合分析服务,助力科研成果转化。
指标 | 参数 |
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检测区域 | 编码及非编码RNA |
仪器平台 | 华大Stereo-seq |
测序数据量 | 2.5G reads(1cm*1cm) |
周期 | 30个自然日 |
适用物种 | 人及大小鼠等真核生物 |
适用样本类型 | 石蜡组织/切片 |
样本类型 | 建议送样量 | 运输条件 |
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FFPE包埋组织/白片 | 石蜡包埋组织封装好后,4°C进行寄送,组织横截面建议不要超过芯片的捕获面积,厚度不少于5mm。石蜡包埋白片或贴片建议准备6-13片(5um 厚度)。 | 将组织放入全新的离心管中,做好标记放入自封袋,在自封袋上做好记录,4℃寄送。 |