3'端测序技术在高通量的单细胞转录组测序中被广泛应用,细胞悬液通过微流控通道,单个细胞被捕获和分离至单独的反应室(液滴或微孔),在每个反应室中mRNA被加上条形码和UMI标签,随后所有带有特异条形码和标签的单细胞mRNA混合在一起进行反转录、预扩增和文库构建。海普洛斯可提供10X Genomics、BD Rhapsody及华大DNBelab C-Taim4等平台的单细胞转录组测序。
(1)全链条,多平台的一站式单细胞测序解决方案
海普洛斯引进了10X Genomics、BD、DNBC4等国内外多种单细胞测序捕获平台,提供从组织消化到结果分析的一站式单细胞测序解决方案。
(2)200+ 肿瘤类型组织样本解离经验
海普洛斯专注于肿瘤临床科研领域,有丰富的肿瘤组织消化经验。除了常规的易消化组织如胃癌、肺癌、肠癌等样本类型,还通过技术优化,对一些疑难组织如胰腺癌、癌旁、血管、脂肪等样本类型有经验优势。
(3)更快,更省,更严格的建库测序方案
具备完善的物流渠道,通过引入8台Novaseq6000及Novaseq Xplus平台,打造超高通量的测序中心,极大的降低测序成本;2023年全国唯二通过NCCL的科服实验室全程严格地质量把控。
(4)多组学联合分析解决方案
通过持续完善的多组学服务,提供单细胞测序结合基因组学、转录组学、蛋白代谢组学、微生物组学等多组学联合分析服务,助力科研成果转化。
指标 | 参数 |
---|---|
检测区域 | 3’mRNA |
仪器平台 | 10X Genomics、 BD Rhapsody、C4 |
测序数据量 | 3W-8W reads/cell |
周期 | 30个自然日 |
适用物种 | 人及大小鼠等真核生物 |
适用样本类型 | 细胞悬液、新鲜组织、新鲜血液、外周血单核细胞(PBMCS)、穿刺样本、冻存组织 |
样本类型 | 建议送样量 | 运输条件 |
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组织 | ≥200mg(黄豆大小,0.5cm3) | 置于组织保存液中,2-8℃48小时内寄送 |
穿刺样本 | ≥2条(16G穿刺针,长度>1.5cm,乳腺癌穿刺3~4条) | 置于组织保存液中,2-8℃48小时内寄送 |
新鲜血液(默认提取PBMC) | 2-4ml,至少1ml | EDTA采血管收集,4℃寄送不超过12小时 |
冻存PBMC | 细胞量不低于30w(至少1ml) | 梯度降温冻存干冰运输,运输时间不限 |
单细胞悬液 | 细胞量不低于30w个 | |
体液 | 细胞总量≥10w(8-15ml腹水、关节液和脑脊液等体液,至少4ml) | 碎冰运输,运输过程中注意做好缓冲保护,避免样本剧烈震荡,短时间寄送,建议不超过4小时 |