Small RNA是一类长度18-30nt 的非编码RNA,主要包括miRNA、 siRNA、piRNA三大类。Small RNA测序是基于高通量测序平台,研究特定组织在特定状态的所有已知small RNA,也可预测新的small RNA及其靶标基因,为研究small RNA的功能及基因调控机制提供有力手段。
(1)全面分析sRNA鉴定分析
可针对样本中的miRNA、siRNA、piRNA等18-30nt小片段RNA展开全面分析,既能鉴定已知sRNA、也能预测新的sRNA并预测sRNA的靶基因,为研究sRNA功能及调控记住提供有力手段
(2)自主研发开源分析软件
优化提速数据的多角度分析
(3)不同丰度sRNA检测
保证不同丰度small RNA都能准确定量
(4)全基因组水平检测调控基因
可在全基因组水平快速鉴定和预测各种类型的small RNA,得到与调控相关的所有基因
指标 | 参数 |
---|---|
检测范围 | miRNA |
仪器平台 | Novaseq xplus/华大DNBSEQ-T7 |
测序数据量 | 3G(10M reads) |
周期 | 30自然日 |
交付标准 | 原始下机数据(fastq格式),Q30≥80% |
适用物种 | 人、大小鼠 |
产品类型 | 样本类型 | 建议送样量 | 保存、运输条件 |
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Small RNA测序 | Total RNA | 浓度>100ng/μl; 总量>600ng |
冻存管保存,干冰运输 |
新鲜动物组织 | 200mg | 液氮速冻,-80℃保存,干冰运输 | |
新鲜植物组织 | 500mg | 液氮速冻,-80℃保存,干冰运输 | |
新鲜培养细胞 | 10^6个 | trizol裂解,-80℃保存,干冰运输 | |
全血 | 4ml | PAXgene管保存,干冰运输 | |
血浆 | 2ml | EDTA管保存,-80℃保存,干冰运输 | |
血清 | 2ml | -80℃保存,干冰运输 |