CircRNA测序(Circular RNA Sequencing)是设计专门用来高通量检测Circular RNA的方法。其原理是利用生物体内含量最多的是rRNA,进而采用去rRNA的方式对其他类型RNA(含Circular RNA)进行测序文库的构建,采用生信分析手段对circular RNA进行系统性鉴定。
(1)CircRNA测序优势
采用的是去核糖体建库的方式,可集中多种RNA信息,包含进行辅助分析mRNA-lncRNA-circRNA之间关联分析。
(2)新circRNA筛选
我们的测序无需预先设计探针,应用于更多的物种,通量高,使用先进软件对样本中circRNA进行筛选,不仅能分析已知的circRNA,更能获得新的circRNA,进一步丰富对circRNA的研究,还可以分析序列水平的信息。
(3)周期优势
海普洛斯具备完善的HiSeq X、NovaSeq6000等多规格的测序平台,常规周期30自然日,极速周期20自然日。
指标 | 参数 |
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检测范围 | LncRNA+mRNA+circRNA |
仪器平台 | Novaseq xplus/华大DNBSEQ-T7 |
测序数据量 | 15G |
周期 | 30自然日 |
交付标准 | 原始下机数据(fastq格式),Q30≥80% |
适用物种 | 人、大小鼠 |
产品类型 | 样本类型 | 建议送样量 | 保存、运输条件 |
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circRNA测序 | Total RNA | 浓度>30ng/μl;总量>600ng | 冻存管保存,干冰运输 |
新鲜动物组织 | 200mg | 液氮速冻,-80℃保存,干冰运输 | |
新鲜植物组织 | 500mg | 液氮速冻,-80℃保存,干冰运输 | |
新鲜培养细胞 | 10^6个 | trizol裂解,-80℃保存,干冰运输 | |
全血 | 4ml | PAXgene管保存,干冰运输 | |
FFPE穿刺切片样本 | 15片 | 常温运输 | |
FFPE组织切片样本 | 10片 | 常温运输 | |
血浆 | 2ml | EDTA管保存,-80℃保存,干冰运输 | |
血清 | 2ml | -80℃保存,干冰运输 |