16S扩增子测序(又称16S rRNA基因测序或16S rDNA测序),通过提取环境样品的DNA,选择合适的通用引物扩增16S的目标区域,通过检测目标区域的序列变异和丰度,以研究环境微生物多样性及群落组成差异。
(1)严格标准的实验流程,分析内容丰富全面
(2)大数据分析团队和多中心大项目分析经验
指标 | 参数 |
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检测区域 | 16S rDNA的1-2个区域 |
仪器平台 | NovaSeq6000 PE250 |
测序数据量 | 3W reads |
周期 | 50个自然日 |
菌群分辨率 | 属水平 |
样本类型 | 建议送样量 | 运输条件 | 生物重复 |
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人粪便 | ≥2g | -80℃保存,干冰寄送 | 一般情况下,自然环境中(如土壤)及模式动物 (如大、小鼠)建议每组至少5个生物学重复, 一般推荐10个生物学重复;若是人类肠道粪便等样品,由于个体之间差别较大, 建议每组不少于30个生物学重复 |
大/小鼠粪便 | ≥200mg | ||
肠道内容物 | ≥1g | ||
唾液样本 | ≥3ml | ||
口腔或皮肤拭子 | ≥5个 | ||
水体滤膜 | ≥2片(5 cm直径) | ||
土壤或淤泥 | ≥2g |