个性化mRNA疫苗III期成功背后:新抗原精准筛选 ——海普洛斯全链条赋能药企研发提速
近期,默沙东与Moderna联合宣布:双方合作的个体化mRNA新抗原疫苗intismeran autogene(原mRNA-4157/V940)联合Keytruda,在高危黑色素瘤III期INTerpath-001研究中,同时达到无复发生存期(RFS)与无远处转移生存期(DMFS)双终点。这是全球首个在III期临床中取得阳性结果的mRNA肿瘤疫苗,也是首个在肿瘤治疗领域III期研究中获得成功的个体化新抗原疗法。资本市场迅速回应——Moderna盘前涨幅一度超过100%,默沙东跟涨约7%,BioNTech亦受情绪带动上涨约10%。
资本市场的逻辑不难理解:mRNA平台的价值从传染病疫苗向肿瘤治疗领域完成了一次关键跨越。但对于新抗原管线研发的从业者而言,更值得关注的是一个基本事实——每一支“一人一药”的个体化mRNA疫苗,起点不在mRNA合成,而在对患者肿瘤突变谱的精准解读。一切疗效,始于测序。
一、个体化mRNA疫苗的完整链条:先有测序,后有疫苗
intismeran autogene并非传统意义上的预防性疫苗,而是一款为患者量身定制的治疗性产品。其制备流程清晰勾勒出“测序先行”的逻辑链条:
- 肿瘤测序:采集患者肿瘤组织与外周血白细胞,对肿瘤样本及配对对照进行全外显子测序(WES)以及转录组测序(RNA-seq),完整获取患者特有的体细胞突变谱;
- 新抗原筛选:基于专有算法,从突变中筛选最有可能被免疫系统识别的新抗原,结合HLA-I/HLA-II高精度分型评估呈递能力,单次最多可编码34种患者特异性新抗原;
- 个体化mRNA合成:为每位患者生产专属mRNA制剂,进入体内后表达新抗原蛋白——相当于向免疫系统递交一份“肿瘤通缉名单”,训练T细胞精准识别并清除残留肿瘤细胞;
- Keytruda“松刹车”:K药解除对T细胞的抑制,让被激活的免疫反应持续发挥作用。两种药物分工明确:mRNA疫苗告诉免疫系统"攻击谁",Keytruda负责"松开刹车"让攻击得以执行。
没有肿瘤NGS测序,就没有"个体化新抗原疫苗"。每一位患者的疫苗,都始于对其肿瘤突变谱的精准解读。这正是高通量测序在精准肿瘤学中的地基性角色。
二、新抗原管线从研发到临床,绕不开的四道关口
intismeran autogene的III期成功为行业指明了方向,但对于国内正在或即将布局个体化新抗原疗法的Biotech而言,“撞线”是远期目标,眼下面临的是一系列从研发到落地的现实难题。其中四道关口,尤为关键:
- 新抗原预测精度不足:WES探针覆盖度不够、RNA易降解、HLA分型不完整,直接削弱候选肽亲和力预测的可靠性——相当于疫苗的“通缉名单”从一开始就存在漏报和误报。
- 中国人群数据缺位:直接套用TCGA等欧美公共数据集,忽略了中国人群特有的高频突变谱与HLA分布特征,筛选偏差在算法层面就已埋下。
- 全流程质控断层:入组筛选、药物设计、机制研究、疗效监测分散在不同服务商手中,数据标准和质控体系不统一,IND申报与临床推进时难以拼齐完整证据链。
- 缺乏灵敏的早期疗效监测手段:影像学评估存在滞后性,无法在治疗早期判断“疫苗+IO”是否起效,待可见复发时,往往已错过最佳干预窗口。
这四道关口,单一平台无法解决。唯有整合底层测序、生信分析与全流程质控,通过多平台协同才能攻克。而这,正是海普洛斯新抗原解决方案的核心发力点。
三、从发现到监测:海普洛斯新抗原全周期解决方案
海普洛斯自2014年起深耕肿瘤NGS测序,围绕新抗原疗法“从靶点到疗效”的完整链条,搭建了一套覆盖三大阶段的全周期解决方案。
- 阶段一:新抗原挖掘与验证。以患者肿瘤组织(新鲜或FFPE)为起点,通过WESPlus全外显子测序进行高置信度体细胞突变检测;同步进行RNA-seq,验证突变在转录水平的真实表达,将“基因组突变”锁定为“可被递呈的候选新抗原”。同时基于WES数据进行HLA分型,配备800余条HLA多态性探针,支持MHC Class I和Class II亲和力预测,覆盖HPV、HBV、EBV三种病毒相关新抗原的筛选需求。基因组+转录组+免疫组的多组学整合分析,确保新抗原“找得准”。
- 阶段二:新抗原特异性TCR筛选与发现。新抗原是否真的被免疫系统“认领”,需要TCR层面的直接证据。海普洛斯提供从bulk TCR-seq到单细胞TCR-seq的完整工具链。bulk TCR-seq对患者外周血或肿瘤组织进行免疫组库测序,完成TCR Vβ profiling与克隆型分析,追踪新抗原特异性克隆的鉴定与应答克隆筛选;单细胞测序平台通过scTCR-seq分析,在单细胞水平匹配TCR表型,实现高亲和力TCR发现与TCR表型精准解析,为药物机理研究提供直接证据。
- 阶段三:临床疗效监测与评估。 治疗前与治疗后动态采集患者血浆与PBMC,ctDNA-MRD对肿瘤来源体细胞变异进行高灵敏度监测,比影像学更早发现肿瘤进展,实现微小残留病灶监测与肿瘤负荷动态评估,鉴定、富集高复发风险人群;TCR-seq同步追踪新抗原特异性克隆的扩增与持久性,监测免疫应答情况。
三个阶段依次衔接,形成发现→验证→监测的完整闭环,贯穿从IND到上市后的全周期。
四、核心能力:中国人群数据+四大技术平台,缩短从靶点到临床的距离
中国人群新抗原挖掘
国内Biotech直接套用TCGA等欧美公共数据集,会因人群背景差异丢失大量中国患者特有的高频突变与HLA等位基因。海普洛斯依托自有测序数据+公共数据库,自主搭建了一套聚焦中国人群的新抗原筛选流程——从体细胞突变与HLA分布特征出发,进行高频突变数据挖掘与富亲和力新抗原筛选,让候选靶点更贴近中国患者。
四大技术平台
- WESPlus:全外显子panel设计,HLA 11基因全覆盖,800+条HLA多态性探针,支持MHC Class I/II亲和力预测;覆盖HPV、HBV、EBV三种病毒序列分析,助力相关新抗原疗法。
- TCR-seq:自主研发免疫组测序技术,技术重复性R²>99%,精准定位T淋巴细胞CDR3区域,检测、解析、追踪TCR序列,跟踪评估新抗原相关免疫疗法的疗效。
- 单细胞测序平台:全链条、多平台、高性价比一站式单细胞测序解决方案,scRNA-seq+scTCR-seq实现单细胞水平免疫组库信息,匹配TCR/BCR双链,T细胞克隆与基因表达谱的链接,实现TCR表型更精准解析,助力新抗原疗法药物机理发现。
- ctDNA-MRD:对肿瘤来源体细胞变异的高精度监测,比影像学更早发现肿瘤进展,实现动态复发耐药监测与药物疗效评估等。
为什么选择海普洛斯
- 服务经验丰富:提供覆盖新抗原疗法生产、研发、临床全流程服务,涵盖临床前、IND申报、临床开发阶段的项目经验。
- 质量体系完善:按GMP标准建立质量控制及配套文件体系,满足监管对生产质量与可追溯性的硬要求。
- 强大生信开发能力:自主研发多款生信分析软件,助力超大量测序下机数据精准、快速分析;深度学习打造亲和力预测自动化分析系统,助力高效筛选高免疫原性抗原肽。
海普洛斯已先后与纽安津、新合生物、中生康元以及立康生命等多家聚焦新抗原疗法的创新药企建立深度合作,积累了新抗原全流程服务经验。基于前期的合作,海普洛斯已具备行业最快的测序交付周期,确保为后续mRNA的生产和质控预留更多时间;具备最完善的解决方案,从前端测序到后端疗效监测以及机制研究,对于新抗原客户的不同检测需求,海普洛斯都能及时响应;具备行业最好管理体系,从下单、样本接收、提取、建库以及下机,全流程都可以在自主研发的LIMS系统上实时监控,并且可以根据客户需求定制化实验和质控记录以满足监管需求。

